軟件介紹SimVector是一款非常專業(yè)的質(zhì)粒圖譜繪制工具,這款軟件擁有非常多的強(qiáng)大功能,我們可以直接使用SimVector官方版來(lái)輕松完成質(zhì)粒圖譜的繪制,讓你成為專業(yè)的繪圖人員。 功能介紹一、計(jì)劃克隆實(shí)驗(yàn) 1、設(shè)計(jì)網(wǎng)關(guān)克隆實(shí)驗(yàn):使用SimVector,您可以執(zhí)行構(gòu)成 Gateway?克隆的BP和LR反應(yīng)。供體載體和表達(dá)載體是BP反應(yīng)和產(chǎn)生進(jìn)入克隆所必需的。LR反應(yīng)和生成表達(dá)載體需要入口載體和目標(biāo)載體。 2、設(shè)計(jì)TA克隆載體:SimVector可以輕松設(shè)計(jì) TA克隆實(shí)驗(yàn)。TA克隆向?qū)Ы邮苌虡I(yè)T載體或限制性設(shè)計(jì)的T載體,并將其與經(jīng)修飾的PCR產(chǎn)物組合。然后,您可以生成高度準(zhǔn)確的重組DNA質(zhì)粒圖譜。 3、進(jìn)行限制性克。嚎寺〖夹g(shù)需要限制性酶切割載體分子和待克隆的分子。SimVector執(zhí)行限制酶分析,并允許您對(duì)所需序列上的限制酶進(jìn)行過(guò)濾,注釋和映射。 4、執(zhí)行限制分析:使用超過(guò)1000種限制酶的綜合數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行限制性分析。SimVector識(shí)別DNA序列中的限制酶識(shí)別位點(diǎn),用于測(cè)定限制酶。提供兩種酶過(guò)濾模式來(lái)指定限制性分析的參數(shù)。酶過(guò)濾使您能夠設(shè)置酶標(biāo)準(zhǔn)以符合您的實(shí)驗(yàn)要求。為方便起見,包括來(lái)自20多家商業(yè)供應(yīng)商的酶套。 二、繪制目錄質(zhì)量質(zhì)粒圖 1、繪制質(zhì)粒圖:用SimVector繪制出版質(zhì)量質(zhì)粒圖。 2、多重克隆站點(diǎn)(MCS)顯示:SimVector通過(guò)解釋GenBank頭文件注釋(可用)來(lái)識(shí)別MCS,或者您可以手動(dòng)指定。 3、支架視圖顯示:它甚至有聰明的只列出在MCS內(nèi)切割的酶和其他地方。這種特殊格式我們稱之為“括號(hào)視圖”。 4、目錄質(zhì)量矢量圖形: SimVector生成矢量圖形格式的質(zhì)粒圖,用于導(dǎo)出到adobe Illustrator 10和Microsoft PowerPoint 2002。 5、導(dǎo)出網(wǎng)絡(luò)就緒圖像:以JPEG,PNG和TIF格式導(dǎo)出高分辨率質(zhì)粒圖,便于網(wǎng)站添加,導(dǎo)出圖像可以進(jìn)行主機(jī)頁(yè)面。 6、圖形Entrez特性:將GenBank注釋轉(zhuǎn)換為圖形特征(線性和圓形序列圖)。 7、創(chuàng)建向量:創(chuàng)建向量圖,而不知道其序列。 三、自定義矢量地圖 1、簡(jiǎn)單樣式:從數(shù)百種字體,顏色,樣式和限制酶和功能的填充模式中選擇一個(gè)按鈕。 2、顏色主題:定義您自己的自定義顏色主題并重復(fù)應(yīng)用。 3、選框選擇:組選擇對(duì)象以快速設(shè)置所有樣式。 4、線性和圓形視圖:顯示圓形和線性質(zhì)粒圖。 5、縮放:放大查看詳細(xì)圖形或進(jìn)行概覽。 6、文本:添加文本以注釋質(zhì)粒圖。 軟件特色1、繪制卓越的出版質(zhì)量質(zhì)粒圖 無(wú)論您是銷售工程質(zhì)粒的目錄公司還是對(duì)重組克隆實(shí)驗(yàn)進(jìn)行限制性分析,SimVector將幫助您模擬實(shí)驗(yàn),并從頭至尾創(chuàng)建出版質(zhì)量質(zhì)粒圖。使用軟件繪制各種顏色,圖案,字體和線條類型的圓形和線性質(zhì)粒圖。以斜體顯示細(xì)菌部分的兩種字體樣式顯示酶名稱,如傳統(tǒng)的。在質(zhì)粒圖中包含特征注釋的任何位置,在單個(gè)文本字中使用多種字體樣式和顏色。 2、多重克隆站點(diǎn) 矢量目錄通常以獨(dú)特的格式顯示MCS,其中酶在垂直列表中一個(gè)上。SimVector通過(guò)解釋GenBank標(biāo)題注釋來(lái)識(shí)別MCS,或者您可以手動(dòng)指定它們。然后,它們以我們稱為“括號(hào)視圖”的特殊格式繪制。它甚至有聰明的人只列出在MCS和其他地方切割的酶。 3、閃電快速克隆模擬 SimVector將GenBank或??本地文件的序列標(biāo)題中的注釋轉(zhuǎn)換為完全說(shuō)明的地圖?寺∠?qū)Э梢砸龑?dǎo)您完成流行的重組方案,例如Gateway克隆和TA克隆,以及一個(gè)和兩個(gè)酶限制性克隆。ORF搜索可以幫助您確保構(gòu)造保留在框架內(nèi)。點(diǎn)擊一個(gè)按鈕,您可以翻譯表達(dá)蛋白質(zhì)的序列,以檢查可能的閱讀框錯(cuò)誤。使用SimVector,克隆模擬就像點(diǎn)擊幾個(gè)按鈕一樣簡(jiǎn)單。 4、限制分析 SimVector具有全面的限制酶分析功能。從一千多種限制性酶的數(shù)據(jù)庫(kù)中選擇,或者使用我們預(yù)先加載的普遍的商業(yè)酶庫(kù)。SimVector還使您可以構(gòu)建自己的定制酶組。 5、生物學(xué)家設(shè)計(jì)的直觀界面 SimVector具有直觀的生物學(xué)家設(shè)計(jì)的界面,可進(jìn)行限制性克隆和序列分析。點(diǎn)擊向?qū)沟眉词箤?duì)于初學(xué)者也很容易使用,而多功能功能可以完全控制專家繪制質(zhì)粒圖。 |
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