軟件介紹

aminoXpress特別版是一款在生物化學行業(yè)里會經(jīng)常用到的CAD應(yīng)用軟件，它可以幫助用戶來處理一些復雜的生物化學問題。我們可以通過aminoXpress來構(gòu)建模塊，并且還可以按照序列輸入?yún)f(xié)議，從而讓你輕松完成生物化學實驗。

aminoXpress特別版軟件功能

1.氨基酸分析:該模塊計算氨基酸分析結(jié)果的最佳殘基比。通過將水解過程中容易氧化的殘留物輸入“未優(yōu)化殘留物”部分，可以將對優(yōu)化結(jié)果的影響降至最低。

2.復合構(gòu)建模塊組成:該模塊基于構(gòu)建模塊(氨基酸、片段)擁有離散的重量值這一事實來識別意外產(chǎn)品的身份。掃描它們的組合后，偏差最小的更有可能是衍生產(chǎn)品。

3.消化模式:該模塊通過用戶定義的酶或化學模式預測消化產(chǎn)物。

元素分析:該模塊計算序列中不同元素的理論百分比。通過進一步輸入每個元素的實驗百分比組成，可以識別其經(jīng)驗公式和/或其聚集體。

4.碎片化:該模塊預測質(zhì)譜中通過三種類型的鍵斷裂產(chǎn)生的碎片:一氧化碳/一氧化碳、一氧化碳/碳氫化合物和碳氫化合物/碳氫化合物。生成的碎片可以直接導入到質(zhì)量模塊中，用于模擬質(zhì)量分布模式。

5.螺旋輪/網(wǎng):這個模塊顯示和操作螺旋結(jié)構(gòu)的順序輪/網(wǎng)顯示。

6.同位素分布圖:這個模塊預測輸入公式或序列的同位素分布圖，以1到3的電荷變化的或模式

7.Lib組合庫:本模塊預測組合庫(如肽庫)的質(zhì)譜，以1-3電荷的或模式進行。直到最后一步才進行質(zhì)量舍入，以確保準確性。此外，該模塊將其預測能力擴展到有機文庫:隨機變體可以是氨基酸、片段或兩者兼有。結(jié)果還包括隨機的截面殘余組合

8.主題發(fā)現(xiàn):該模塊通過模式識別預測序列中潛在的藥物活性位點。它有助于掃描預設(shè)模式或隨機重復模式、潛在的藥效團，以及展示相同生物活性的加載序列。

9.分子量:這個模塊計算肽和蛋白質(zhì)的分子量。輸入可以通過常規(guī)的序列方案進行，也可以通過構(gòu)建模塊如氨基酸和片段進行。替代方案使模塊能夠計算復雜分子的分子量，例如具有保護基團的肽、肽模擬物、長分子和分支分子等。原子量的進一步使用通常擴展了模塊計算任何化合物分子量的能力。

10.數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)庫管理:這個輔助模塊允許用戶管理在這個程序中使用的所有數(shù)據(jù)庫，如氨基酸數(shù)據(jù)庫，片段附加數(shù)據(jù)庫...等等。開放式設(shè)計允許用戶根據(jù)他們的特定項目定制數(shù)據(jù)庫。

11.序列序列加載器:這個輔助模塊允許用戶將序列加載并解析到相應(yīng)模塊的入口部分。專家系統(tǒng)自動識別諸如側(cè)鏈、環(huán)狀結(jié)構(gòu)、假替換和附加加合物的屬性。